Caractériser le microbiote du sol pour renforcer la bioprotection

La connaissance de la vie des sols grâce aux biotechnologies ouvre une troisième voie d’application, en lien avec deux autres piliers de la protection des cultures : la bioprotection et l’agriculture numérique.

Les racines des plantes abritent une grande diversité de micro-organismes, notamment des bactéries et des champignons. Ils vivent autour des racines ou à l’intérieur de la plante. Constituant une partie du microbiote du sol, ils contribuent directement à la santé des plantes. Certains forment une barrière protectrice et favorisent la croissance racinaire. D’autres, en revanche, dégradent les parois cellulaires et pénètrent dans la plante pour la contaminer. Entre ces deux groupes, une compétition s’instaure. En cas de prolifération de champignons pathogènes, la plante réagit.

«En comprenant mieux le fonctionnement du microbiote du sol, les chercheurs peuvent créer des bioproduits qui interagissent positivement dans la croissance de la plante, ajoute Marie Rigouzzo, responsable du groupe biotechnologies pour Phyteis. L’objectif est de booster l’immunité naturelle des cultures mais aussi de les protéger contre les maladies. »

L’ingénierie du microbiote en lien avec la santé des plantes est émergente. Si l’essentiel des travaux concernent les synergies avec les micro-organismes du sol, de nouveaux domaines d’exploration s’ouvrent avec les graines. Elles contiendraient des milliers de micro-organismes, mais fait intéressant, environ 30 taxons bactériens et fongiques sont présents chez la plupart des espèces végétales et dans des échantillons du monde entier. La germination des graines exigerait donc un microbiote « minimal » qui stimule ce stade primordial du développement d’une plante.

* Projet collaboratif impliquant le Max Planck Institute for Plant Breeding Research – MPIPZ, Inrae, l’université de Lorraine et le Joint Genome Institute

** Travaux des chercheurs Inrae de l’Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS) réalisés dans le cadre du projet SUCSEED (Stop the use of pesticides on seed) du Programme prioritaire de recherche Cultiver et protéger autrement.